美國政府在世衛組織十多名專家抵達湖北武漢，將就新型冠狀病毒展開溯源調查工作之際，再度指病毒可能源自武漢病毒研究所，敦促世衛在病毒源頭問題繼續向中方施壓。國務院及國務卿蓬佩奧分別發聲明，提出3點指控，指華府有理由相信研究所內多名研究員，早於2019年秋天已不適，病徵與新型冠狀病毒及一般季節性流感一致，令人質疑研究所研究員石正麗曾公開指研究所內人員「零感染」的可信性。

聲明又指，武漢病毒研究所自2016年開始，已對一種來自蝙蝠的冠狀病毒(RaTG13)進行研究，這種病毒與新冠病毒的相似度達96.2%；又指武漢病毒研究所雖然自稱是民間機構，但華府認定研究所與中國軍方有秘密合作項目，包括進行動物實驗等機密研究。蓬佩奧批評北京繼續扣起科學家需要，可以保護世界免於這種致病病毒及下一種病毒的重要資訊，國務院要求世衛專家必須取得疫情爆發前，研究所就蝙蝠及其他冠狀病毒研究工作的紀錄。