台灣的國防部規定，轄下科研機構中山科學研究院人員，日後離境前必須先申請，即使獲批，受規範人員亦不得在大陸、香港和澳門等地方轉機，更不得進入這些地區，受影響的包括院長、副院長，以及替代役等約1萬人。
相關的條例草案提到，中科院受託承接重要的軍事建案和科技研發，涉及不少機密，應依法善盡機密維護之責，以確保台灣安全及利益。