基礎設施互聯互通是大灣區城市合作的重要一環，目標是構建現代化的綜合交通運輸體系。在港珠澳大橋啟用後，有珠海的物流業界人士認為，與香港有龐大的合作空間；本港機管局行政總裁林天福亦認同，本港機場加強同大灣區其他城市合作，有力成為中國以至亞洲物流中心。

要加強大灣區內的人流、物流，城市間的交通基建必不可少。《粵港澳大灣區發展規劃綱要》提到，要構建以高速鐵路、城際鐵路和高等級公路為主體的城際快速交通網絡，力爭實現大灣區主要城市間一小時通達。單是在香港，去年經已有廣深港高鐵香港段，以及港珠澳大橋兩項跨境基建啟用。

來自廣州的張瑜杏，去年應邀加入珠海港旗下的珠海港達供應鏈管理有限公司，擔任總經理。現時她逢周一至周五在珠海上班，周五晚駕車一個半小時，回廣州陪丈夫和兩個兒子過周末。她說隻身來到珠海，是看到港珠澳大橋開通為珠海帶來的機遇，大橋開通後，由珠海保稅倉運貨到香港，只需大約一小時，而珠海的倉儲成本只是香港的六分一到八分一，據她估算，以一個五萬呎倉庫為例，珠海的倉租一年可以較香港便宜一千萬。他們經已跟一間本港的大型雜貨連鎖店合作，將原本在香港分揀打包的商品，移至珠海保稅倉處理，客戶提出的要求，他們可以即時滿足：「例如(香港客戶) 早上通知我，說香港缺貨，可否即日安排運貨到香港？其實是可以的，我們由收到指令，到在珠海貨倉執貨，到安排中港車下午直接到達香港，是可以實現的。」

張瑜杏預期內地進口市場將會蓬勃發展，並相信內地發展跨境電商，符合國情和國策，珠海和香港可以加強合作，在珠海設立跨境及冷鏈物流的綜合分撥倉，結合香港機場貨運優勢，加上珠海倉儲成本低，讓貨品快速往返內地及世界各地之間，海外產品先運到香港機場，再經港珠澳大橋運往珠海保稅倉，然後以電子商貿銷售到內地。「會有水果、蔬菜、海產品、接下來會有藥品類的冷鏈.......(可以供應貨物到)珠三角，以及一些內陸城市，我們可以先由香港機場快速落地，再運到珠海的綜合分撥倉，並根據(客人對)貨物的需求，運送到不同的地方。」

《粵港澳大灣區發展規劃綱要》提到，要推進粵港澳物流合作發展，大力發展第三方物流和冷鏈物流，提高供應鏈管理水平，建設國際物流樞紐。香港機場管理局行政總裁林天福認同，將來本港機場加強同大灣區其他城市合作，有能力成為中國以至亞洲物流中心，香港國際機場亦積極發展冷鏈物流，2018至2019年，先後成為國際航空運輸協會醫藥品冷鏈運輸（IATA CEIV Pharma）認證，及鮮活貨物運輸（IATA CEIV Fresh）認證的認可合作夥伴機場。林天福說要作為樞紐機場，必定發展高端物流：「近幾年亞洲經濟發展迅速，大家對高端消費品需求大，高端貨品流轉的時效非常重要，例如藥物、鮮活貨、奢侈品等。這些貨物的物流特點是時效性強，出廠後不能待三兩個月才付運，要兩星期、甚至數天便要運到，因此我們將來作為重要的樞紐機場，空運貨運的方向第一便是發展高端物流。」

除了貨運，大灣區亦要提升客運服務水平，包括推進大灣區城際客運公交化運營，推廣「一票式」聯程和「一卡通」服務。本港的運輸及房屋局早前和中國民航局簽訂備忘錄，同意擴展「陸空多式聯運安排」，讓旅客將來乘搭飛機，可以憑同一張機票接駁高鐵或港珠澳大橋穿梭巴士等，連接內地城市。林天福說，機管局計劃合共在大灣區29個地點，設置城市候機樓，現時經已有超過一半啟用，期望將來讓旅客體驗多式聯運：「希望做到不論外國人、以及大灣區的人，都可以將區內船、車、火車、飛機等行程，合併為聯票即『一票通』，做得到的話，可以進一步令旅客更多選擇，大灣區幅射全中國、全亞洲的能力亦會更強。」

大灣區要提升口岸通關能力和通關便利化水平，促進人員、物資高效便捷流動，除了加強硬件，亦要加強通關效率。香港中小型企業商會會長巢國明說，近年內地引入電子化報關，經已加快貨物流動，他認為如果要進一步加強，香港和內地海關可以研究互相通報貨物信息：「如果想再快點、方便點，將來可能要在香港海關報關，及內地海關報關方面，大家有電子信息，可以在網上交換資料，例如當有貨物在內地報關的話，香港可以同時得悉有關的貨物資訊，在過境時便會更暢順......現時大家可能擔心交換信息帶來的問題，但相信只要大家把好關，問題應該不大。」

中央在今年三月，就推進粵港澳大灣區建設推出的八項政策措施，當中便涵蓋內地繳納個人所得稅關於「183天」的計算方法，在中國境內停留的當天不足二十四小時，不會計入中國境內居住天數。隨著大灣區跨境基建加強，香港旅客前往更多內地城市，可以做到即日來回。巢國明認同，有基建和政策配合，可能令部分商界人士，採用新的交通模式：「以往到廣西或其他省份一趟，可能需時一兩日，現時有了高鐵，便可以當日往返；至於往返的頻率或時間，則視乎個別商界人士在大灣區的生意模式，例如做零售、飲食業，便要長時間留在內地，但是對於從事貿易，或者home office 的商界人士，便可能會有更多時間在港。」