德勤中國國際稅收及企業併購稅務總監李茂林表示，內地稅務總局正研究處理A股徵收利得稅問題，由於滬港通操作層面牽涉到很多海外機構投資者，亦要一併處理RQFII和QFII稅收問題，預料未能在滬港通落實前完全解決。他預期，局方傾向考慮滬港通開通時暫時不徵稅，但不排除設立稅款追溯期。
他又表示，雖然目前RQFII和QFII仍未正式徵稅，但機構投資者已預留相當於利潤最多一成的資金，應付可能出現的稅項，相信滬港通機構投資者亦會先作撥備。