立法會交通事務委員會委員李卓人認為， 高鐵一地兩檢五年來未達成共識，加上超支，提議西九龍總站地盤停工，改為興建商業城。委員會主席田北辰反對，指一旦喝停工程，仍須向承建商付錢，最終可能都要花八百多億。他要求政府與港鐵盡快就超支責任達成共識，不要為面子訴諸法庭。他們需要在明年中之前，取得立法會追加撥款，否則工程有爛尾危機。
理大土木及環境工程學系副教授熊永達假設最壞情況，高鐵做不到一地兩檢，可以將港穗直通車搬到新的高鐵軌道，減輕東鐵線壓力。廠商會會長李秀恒指，任由工程爛尾是晦氣說話。他批評提出「爛尾」建議的人不負責任，不利香港經濟貿易發展。