機管局降低原先建議因為興建機場三跑道而收取的機場建設費，短途過境或轉機旅客的建設費收70元，經濟客位短途收90元，長途客收160元；頭等及商務客位，短途收160元，長途180元。機管局行政總裁林天福指，預計有七成旅客只需付九十元，不認為收費水平會影響機場競爭力。新收費最快在明年中實施，直至償還所以債務，有機會實施到2028年或2031年。

林天福指，新方案下，機場建設費佔整個三跑工程費用的融資比例一成八，借貸額則是六百九十億元，佔融資比例四成九，機管局亦會發行零售債券和伊斯蘭債券融資。機管局預計新方案會導致淨收入減少160億元，因此要從市場額外借貸，機管局財務執行總監羅志聰說，未來只要政府繼續全資擁有機管局，主權AAA級評級不會改變，新方案的風險雖然增加，但財務安排仍可接受，機管局曾做過壓力測試，認為有能力應付融資，不用向立法會申請額外撥款。行政會議今年三月通過機場第三跑道工程，預料2023年落成，造價達一千四百一十五億元。