金管局與上海清算所就債券通的託管及結算安排發出聯合公告，指初期的北向債券通，是通過金管局債務工具中央結算系統(CMU)與上海清算所之間的託管及結算安排，在互聯互通機制下，投資在內地銀行間債市。
境外投資者透過債券通進入內地債市，可投資範圍與原有供外資參與的範圍一樣，上海清算所登記託管的產品均屬可投資「標的」。
交易採取多級託管模式，上海清算所為總登記託管機構，CMU為次級託管，雙方將簽署協議明確相關的權利與義務。而債券通下的交易均提供全額清算及逐筆結算服務。雙方將起草相關規則，報經兩地監管部門後批准實施。而南向通的安排則待兩地部門決策另行公告。