審計署報告揭示，土地註冊處部分地區的查冊中心使用量低，虧損嚴重，在一二／一三年度起五個年度，荃灣、大埔和元朗查冊中心每年虧損九十萬至二百萬元不等。審計署指，文件註冊是土地註冊處的主要服務，佔營業額比例甚高，但送交註冊的土地文件數目近年大跌，相關業務轉盈為虧，一五／一六年度虧蝕八千萬元，認為土地註冊處需要檢討業務運作。
審計署指，立法會零九年起研究實施土地業權註冊制度，但制度至今仍未實施，當局要加倍努力。審計署亦指，土地登記冊資料出錯頻仍，每年獲更正的錯誤介乎五千七百多至七千五百多項不等，認為處方要提升準確度。