人民銀行亦預備好海南自由貿易港封關的金融準備工作，人行海南省分行發布《海南自由貿易港多功能自由貿易賬戶業務管理辦法》，為跨境資金自由流動提供制度保障。另外多功能自由貿易賬戶（EF賬戶）上線運行。截至10月底，海南省11家銀行上線多功能自由貿易賬戶，業務量折合超過2500億元人民幣；開戶主體與80個國家和地區發生資金劃轉。
此外，亦都進一步健全跨境資金流動監測預警機制，跨境金融風險防範能力全面提升。