日本亦有意派遣海上自衛隊到索馬里海域加入護航。首相麻生太郎指示防衛相濱田靖一，加快探討相關事宜。共同社報道，若執政聯盟內達成共識，東京政府最快下月根據自衛隊法，下達命令，以”海上警備行動”名義派遣自衛隊，最快二月加入護航。不過濱田態度謹慎，認為要再進行充分討論。 根據自衛隊法，自衛隊只可以在正當防衛及緊急避難時使用武器，同只可保護日本船隻。有隊員擔心，一旦遇上海盜，但限制使用武器，生命就會受到威脅；若護航對象只限於日本船隻，亦可能會擾亂國際合作。