菲律賓當局在處理挾持本港旅客事件時出錯。菲律賓調查委員會，第二日就挾持人質事件進行聽證會。當日有份同槍手門多薩談判的總督察薩爾瓦多作供時表示，警方將門多薩的其中一部手提電話，錯誤當作是人質的手提電話，交了給香港警方。本港警方暫時未有回應。
事件可能令菲律賓當局，追查槍手通話紀錄時，存在困難。調查委員會主席、菲律賓司法部長德利馬，下令國家調查局，必須查出與槍手最後通話的人的身份。另一名有份參與談判的警員，早前作供時表示，槍手門多薩一邊讀申訴專員寫給他的信件時，一邊講電話，期間情緒變得激動，指信件是垃圾。