日本首相菅直人在眾議院接受議員質詢時說，日美計劃十二月舉行的島嶼防衛聯合軍演，並非針對釣魚台事件，日美亦無模擬釣魚台事件實施演習的計劃；美國國防部發言人早前亦證清，十二月的美日軍演，同撞船事件無關連。 日本自民黨總裁谷垣禎一在眾議院，批評民主黨政府在撞船事件給中方錯誤的信號，以為祇要施加壓力，日方最終就會屈服，菅直人反駁說，是基於國內法作出妥善處理，所謂"錯誤信號"是無稽之談；民主黨幹事長岡田克也表示，中日在撞船事件後要重新搭建關係。