菲律賓政府聲言，不會在中國新版護照蓋印，指這樣做即是承認中國擁有全部南海主權，他們會在另發的入境簽證申請表格上蓋印。中國新版護照內頁，將南海，包括與菲律賓及越南有爭議的海域，及與中印有爭議的藏南地區，劃入版圖，越南日前已揚言不會在中國新版護照蓋印，印度就提出抗議。

在北京，外交部發言人洪磊表示，中國新版護照加強技術性，便利中國公民出入境，圖案問題不應過度解讀，中方願與有關國家保持溝通，促進中外人員往來的健康發展。