埃及就新憲法舉行第二輪公投之際，副總統馬基突然辭職。國營電視台讀出馬基的聲明，透露上月七日已提出辭職，但其後因調停以巴在加沙停火，及協助安排全國對話，迫使他留任，而他身為法官，早已知道政治不適合自己。新憲法將撤銷副總統一職，馬基曾經表示，當新憲法獲公投通過後，他就會辭職。在總統穆爾西早前頒佈擴大總統權力的法令，引發反對派及民眾示威後，馬基曾號召各黨派會談，尋求達致全國團結。穆爾西其後撤回有關法令。

新憲法第二輪公投，在十七個省進行，但有人權組織指，公投期間出現違規情況，包括有票站延遲開放；有伊斯蘭信眾在票站外非法拉票，呼籲選民投贊成票；亦有部份已去世的民眾，仍然列入選民名單。