日本政府聲稱，不承認中國政府劃設的東海防空識別區，但日本兩間航空公司、日航及全日空決定向中國政府遞交飛行計劃書，他們表示，如果不遞交飛行計劃書，萬一在中國防空識別區遭到攔截，就會有飛行安全問題，接受是唯一的選擇。而台灣的交通部人士透露，台方已開始向大陸民航管理當局，通報由台灣出發，途經東海防空識別區的航班飛行計劃，每日約有一百個班次，包括飛往兩岸、日本、美國、加拿大及經俄羅斯領空往歐洲的航班，