印尼政府表示，擔心中國對南海的領土主張，包括印尼位於九段線內的納土納群島，更表示可能將事件提交國際法院處理。在北京，外交部發言人洪磊表示，印尼對南海群島並無領土要求，納土納群島主權屬於印尼，中方亦不表示異議。至於雙方存在的海洋爭議，中方一貫主張通過積極談判協商，在尊重國際法和歷史事實基礎上，找到妥善處理辦法，做法合符國際法，亦尊重各國在南海各方行為宣言的莊嚴承諾。當前中印尼全面合作伙伴關係正順利發展，中方希望雙方共同努力，將關係不斷推向新水平。