日本首相安倍晉三召開國家安全保障會議後決定，五月底會結束陸上自衛隊在南蘇丹為期五年的維和任務，指南蘇丹的建設已進入新階段，自衛隊是時候撤走，但日方會繼續向當地的聯合國維和行動司令部，派駐人員，未來亦會繼續向南蘇丹提供食物及人道援助。內閣官房長官菅義偉表示，決定撤走自衛隊是經過通盤考慮，否認同南蘇丹治安惡化有關。
日本政府在二零一一年，派遣三百五十名自衛隊員到南蘇丹，協助修建道路橋樑，但根據戰後和平憲法不能參與戰鬥任務。內閣去年十一月通過決議，賦予自衛隊「馳援護衛」新任務，若有需要時可使用武力，保護聯合國人員及平民。