中方否認被指虐待新疆穆斯林，國務院新聞辦公室人權事務局處長李曉軍，在瑞士日內瓦出席聯合國人權理事會會議時，向記者否認中方虐待穆斯林，指當局在新疆設立的是教育及培訓中心，以防止極端伊斯蘭主義蔓延，反指歐洲國家未有處理好這個問題，又指中國是向英國學習監視民眾。李曉軍強調，設立教育及培訓中心是新疆公安為公眾利益而採取的正常行動。
新任聯合國人權事務高級專員巴切萊特日前表示，中國政府隨意拘押穆斯林的舉動令人擔憂，要求允許聯合國派人進入新疆。