繼續在日本訪問的教宗方濟各，到訪二戰原爆地長崎，呼籲全球廢除核武，又與原爆倖存者會面。大批信眾冒著風雨，到美軍當年投下原子彈的地點，迎接教宗。方濟各在儀式中，帶領祈禱，並向原爆死難者紀念碑獻上花圈和燃點蠟燭。他發表講話，促請各國停止軍備競賽，共同為無核世界努力，又重申支持2017年獲聯合國約三分二成員國通過的《禁止核武條約》。
教宗之後到訪16世紀天主教傳教士被處決的26聖人殉教地，再在長崎市棒球場主持大型彌撒。教宗之後會轉到另一個原爆城市廣島。