南韓日前因應東京奧運官方網站，將南韓稱為的獨島、日本稱的竹島，標記為日本領土，向日本提出抗議並要求糾正。日本政府表明拒絕，官房長官加藤勝信指，無論參照歷史事實還是國際法，竹島都是日本固有領土。東京奧組委已說明有關的奧運地圖是客觀標註，並引述《奧林匹克憲章》，反對政治介入體育。
東京奧運會官網的火炬傳遞路線圖，在日本島根縣上方標出小點，將獨島標記為日本領土。南韓政府19年7月曾提出抗議，要求刪除，但日方未有理會。東京奧組委其後更換路線圖，將標記換成肉眼看不見的點，但放大時仍能發現相關標記。