東京奧組委否認，南韓的大韓體育會所指，國際奧委會決定禁止在奧運場館展示具戰爭象徵的「旭日旗」。大韓體育會相當於南韓奧委會，會方指與國際奧委會磋商後，對方以書面形式表示，已決定將禁止政治宣傳活動的《奧林匹克憲章》第50條涵蓋「旭日旗」，在未來的奧運會適用。事隔一日，東京奧組委秘書長武藤敏郎表示，向國際奧委會確認後，獲告知國際奧委會並未作出有關決定，對方表示一般來說並無禁止使用「旭日旗」，至今原則不變，會按個別情況決定；而國際奧委會今早已向韓方提供書面說明。

東京奧運開幕前，南韓代表團在選手村掛起含抗日意味的橫額，遭國際奧委會形容具挑釁性，要求拆下。韓方當時指，國際奧委會已答應，日本亦不能在奧運場館展示「旭日旗」。不過，南韓傳媒其後報道，有社運人士在選手村附近舉起「旭日旗」，又指奧組委已裁定奧運場館不會禁用「旭日旗」，引來南韓民間不滿，指「旭日旗」象徵軍國主義，令人回想起軍事侵略的傷痕。