日本有機構估計，若南海海槽大地震發生，往後20年的經濟損失可能達1466萬億日圓，折合港元約79萬億元。由研究人員和建築業人士組成的日本土木學會發表報告，估計南海海槽大地震後建築物倒塌等財產損失，將達225萬億日圓，對GDP的經濟損失達1241萬億日圓。今次估算的金額較2018年對上次估算高，亦是政府估算的5倍。學會解釋，日本政府只計算災後1年的影響，學會則考慮災後20年的損失，因此估算金額較高。
日本政府早前將南海海槽未來30年內發生大地震的機率，上調至約80%，估計造成29.8萬人喪生。