政制及內地事務局副局長陳岳鵬表示，選舉管理委員會收到一百八十名選民投訴，指他們在九月立法會選舉中，未能在超級區議會的功能界別中投票，翻查紀錄後，發現相關選民在提交表格或更改資料時，曾經選擇不登記為超區的選民，因此選舉事務處按照他們的意願行事，他們只可以在地區直選投票。陳岳鵬又指，今次選舉有三十八個票站，在原訂十時半結束時間之後的半小時內，仍未完成投票，原因是投票人數顯著上升，較多選民在較後時間投票，票站容量和面積未足以應付人潮，選管會正進行檢討，並會提出改善措施。
另外，陳岳鵬又指，今次選舉有五個票站，派出選票和收回選票的數目出現明顯差異，選舉事務處正進行調查，並會載入之後發表的報告書。