林鄭月娥在施政報告提到，過去數月法院對個別案件的判決引發了部分人對司法獨立的負面評論，甚至有人懷疑法庭受到外來干預，強調基本法寫明本港享有獨立的司法權和終審權，法院獨立進行審判，不受任何干涉。林鄭月娥說，香港高質素及獨立的司法制度彌足珍貴，對法院不偏不倚地行使司法權，充滿信心。特區政府會繼續堅定不移地捍衞司法獨立，維護及尊重法治精神，並擔當《基本法》的維護者和法治的捍衞者。
為了確保司法機構有效運作，施政報告說，會接納司法機構提出改善法官及司法人員服務條件的具體措施，將高等法院大樓，重置到立法會大樓毗鄰，屬中環新海濱的五號用地，以及興建一座區域法院綜合大樓。而法律援助署會由原屬的民政事務局，撥歸政務司司長辦公室，以彰顯法援制度的獨立性。