港鐵東鐵線今年1月發生故障，全線暫停運作兩小時，港鐵在立法會一個委員會上表示，事故起因在於列車控制系統有隱藏的編碼誤差，和東鐵線信號提升工程無關，港鐵會更新出問題的軟件，確保可以消除今次的問題，並正和運輸署研究接駁巴士可否增加路線，改善排隊安排，並正和入境處溝通，如出現事故，可以及早通知由內地來港的乘客，讓他們可以選擇使用其他口岸。
多名議員批評港鐵安排不當，民主黨林卓廷批評接駁巴士指示不清，民建聯陳恒鑌就批評資訊發放不當，以致長時間被困列車的乘客走入路軌，阻慢恢復行車的工作。港鐵表示，當日要時間派員到路軌鎖定波口才能恢復行車，疏導乘客；未來會加強公眾教育，呼籲乘客遵循車長指示，不要擅自進入路軌，以免發生危險。