運輸及房屋局副局長蘇偉文在立法會工務小組委員會上表示，機場三跑道系統工程複雜，政府交付機場管理局的委託費用，佔整體工程費的16.5%，較一般政府工務工程的12.5%高。他解釋，是考慮到工程的獨特性，及有額外的保險費用，因此要採用收回成本的方式處理，強調費用水平合理，政府亦很有信心可以在175億元預算內完成政府設施工程。
對於政府被質疑以「斬件式」提交撥款申請，蘇偉文說工程涉及實際工地預算，因此政府要在初步規劃後，才能確立實際工程費用。