運輸及房屋局長陳帆在立法會回應急切質詢時指，並無證據顯示上星期二港鐵四綫同時故障，與更新信號系統工程有關，指港鐵初步調查顯示極大可能是源於現有訊號系統軟件，出現運作和數據處理不暢順，機電署已要求港鐵兩個月內提交報告，港鐵暫時會將各綫連繫分離，確保各綫路不會因同類事故而互相影響。他說，運輸署亦會檢討應變計劃，包括港鐵免費接駁巴士安排、其他公共交通有否空間加強服務等。陳帆指，接駁巴士運載能力始終有限，亦受路面交通影響，不能替代正常鐵路服務，希望大眾理解。
議員批評目前對港鐵的罰則太輕，欠缺阻嚇力，陳帆指明白市民不滿，正與港鐵嚴肅跟進，希望達成共識，令罰則反映事故嚴重性，要有理有節，也不能對復修和營運人員構成壓力，影響鐵路安全。