台灣的總統當選人馬英九表示，對於昨日的入聯公投及返聯公投，都未獲通過，馬英九指，台灣人很想重返聯合國，但法例規定，除非立法院在三年內提出決議，否則不能再提有關公投，因此會暫時凍結，又認為民進黨提出，以台灣名義加入聯合國的做法，會造成災難。馬英九表示，會致力爭取參與五月舉行的世界衛生組織大會。馬英九又否認自己反日，形容是本世紀最大誤會，強調歷史的傷痛不能忘記，但可以暫時？開，務實的領袖應知道如何處理。他強調會促進和日本的經貿關係，維護和平。