審計署批評運輸署，處理校巴和村巴的營業證申請時，未有按既定程序。按照規定，合約式出租服務開始十四日前，應該向署方申請營業證，但運輸署有十六宗個案，並無在規定日期前申請，有一宗個案是在合約屆滿後，才作出處理，審計署指是浪費人力。另外有七宗個案，是在營業證到期後，才申請續期，平均有三星期是無證行車。審計署又發現，運輸處雖然有向營業證過期的人，發出警告信，但未有將禁制令輸入電腦，亦沒有轉介採取執法行動，建議運輸處檢討，將紀錄電腦化和加強執法，運輸署表示同意。