在台灣，被指涉及侵吞秘密外交經費的前行政院長邱義仁，與及前外長黃志芳，都否認有份侵吞款項。邱義仁對記者說，台灣傳媒近日有關事件的報導歪曲事實，又批評指檢察官今日再搜查他住所的報導失實。對於中間人吳思材被捕前寫下一封「保命信」，指稱二千九百萬美元匯回外交部的慶寧公司帳戶，交給邱義仁、前國防部副部長柯承亨及前外長黃志芳。外交部就反駁說，如果外交部收到款項就不會發生這條案。另一名被指逃到美國的中間人金紀玖，透過律師說，最遲會於本月二十日見傳媒，交代事件。