政制及內地事務局長林瑞麟，在一個兩岸三通研討會上表示，預期兩岸三通，短期會令香港經濟增長放緩，但相信只要內地及台灣企業發展成熟，就會來港上市，長遠鞏固香港金融中心的地位。港府今年開始邀請台灣不同界別人士，來港觀察本港一國兩制的落實。政府經濟顧問郭國全就說，兩岸實施三通，在某些方面可能會不利香港，例如航機不必停留香港，但另一方面，相信會帶來新的業務和機遇。