對於馬時亨離任商務及經濟發展局長一職，行政長官曾蔭權說感到可惜，並衷心感謝他的貢獻。曾蔭權說，馬時亨六年前離開私人機構，加入政府，充份表現他對國家及香港的承擔。馬時亨過往曾面對許多財金、庫務及商務的挑戰及棘手問題，都一一迎刃而解。他祝願馬時亨離任後好好休息，早日康復。