政府與新鴻基就確保馬灣公園可按時完成，及讓公眾參與管理公園簽訂補充協議。內容包括，成立一個包括公眾人士在內的諮詢委員會，為持續營運馬灣公園提供意見。另外，馬灣公園有限公司將會成立儲備金，用作維修、保養及改善公之用，如有累計赤字，會由新鴻基承擔。政府發言人指，馬灣公園是由公帑興建的設施，而新鴻基將會確保公園在可持續的基礎上營運。政府十一年前向新地批出馬灣土地發展珀麗灣住宅物業時，政府少收八億三千多萬補地價，以換取新地代政府興建馬灣公園，並協議第一期設施於零六年底啟用。由於馬灣公園的原本構思與香港迪士尼樂園在概念上重疊，新鴻基零三年建議，改為以「香港大自然」為主題，獲城規會批核，但第一期工程要延至年底才完工。