審計報告批評食環署無積極改善街市部份檔位租金差距太大、檔位長期空置問題，令街市營運出現一億六千萬元虧損。審計署長鄧國斌指，食環署當年以特惠租金，吸引流動小販搬上街市經營，造成今天同面積不同租金的不公平情況，應研究是否按通脹調整特惠租金，但現時經濟艱難時期，難以即時加租。 審計報告指，全港約一半食環署街市檔位，繳交低於市值六成租金，其中牛頭角街市一檔濕貨檔，月租112元，只是市值租金的百分一，其他街市同面積檔位的租金差距介乎六成七至九成七。尖沙咀金巴利街街市，地庫檔位長期空置，建議收回。食環署表示，正檢討租金調整機制，並研究是否繼續保留金巴利街街市。