廣州確診首宗甲型H1N1流感個案後，邊境口岸加強檢疫措施，旅客乘搭直通車在廣州東站入境時，要填寫健康申報表，亦有檢疫人員戴上口罩，為旅客量度體溫檢測。

有直通車乘客表示擔心，會加強個人衛生，不時洗手，亦有廣州司機說，經常接載境外人士，自己要加密消毒車廂及開窗令空氣流通。