在台灣，屏東風災災區的萬丹鄉灣內村，有三百人發燒，初步排除是甲型H1N1新流感，相信是進行清理時，皮膚受細菌感染導致發燒。而屏東縣有十三個救災官兵發燒，國防部證實，其中十人是患上甲型流感，徵狀輕微。