在台灣，馬英九總統早上到南投視察災情時說，經已決定讓西藏流亡精神領袖達賴喇嘛訪台，為風災災民祈福。總統府官員較早時說，是基於人道與宗教理由，願意考慮讓達賴到台灣。立法院長王金平說，達賴訪台不可能完全對兩岸關係無影響，但希望大陸方面體諒台灣的情況。而在北京，國台辦未有回應；但台灣傳媒引述中共對台事務權威人士，指台灣拒絕大陸派醫療隊，反而南部縣市就去邀請達賴，形容是情何以堪。 另外，有報道，民進黨籍立法委員，建議亦都邀請教宗訪問台灣慰問災民。早前有評論，質疑民進黨人邀請達賴的動機，指災民不少都是，信奉基督教的原住民。