西藏流亡精神領袖達賴喇嘛到台灣，為水災災民祈福，開始影響兩岸關係，台灣傳媒引述消說，大陸方面形容今次事件令國共互信，毀於一旦，大陸關注達賴在台的活動，不排除會引發更大政治衝擊，北京為表達不滿，取消今日多項兩岸直航新增航點啟動儀式，亦不會派運動員出席周六台北國際聽障奧運的揭幕儀式。 國台辦昨晚達賴抵達台灣時，第二度發聲明，指事件勢必對兩岸關係造成不利影響，消息說，大陸已透過渠道了解總統馬英九批准達賴赴台的決策過程，對馬英九、副總統蕭萬長、行政院長劉兆玄及國民黨主席吳伯雄等都贊同，感到非常不解。