在台北，總統馬英九傍晚召開記者會，表示決定由吳敦義，接替辭職的劉兆玄，做新任行政院長，是因為吳敦義是台灣政界中，罕有具有北部、中部及南部政治資歷，政治經驗豐富，頭腦冷靜，希望由吳敦義組閣，借重他的廣泛經驗，及對政治問題的精準掌握，定能為台灣帶來新氣象。吳敦義就表示，一定會全力以赴，新內閣將提升執行力及競爭力，以應付天災及國際環境帶來的困難。 馬英九又強調，八八風災被毀的道路及橋樑九成已修好，但真正的重建工作才剛開始，今後遇到天災，不管民間及軍方都會充分配合，並要做到防災重於救災，根本做好治山防洪工作。