在台灣，高檢署特偵組完成對前總統陳水扁，涉嫌侵佔機密外交款項的偵查，檢察官決定依觸犯貪污治罪條例，起訴陳水扁、前國安會祕書長邱義仁，及前外交部次長高英茂；檢察官指，陳水扁利用十一次外訪機會，侵佔三十三萬美元外交款項 ，給兒子陳致中到美國留學，邱義仁則涉嫌詐領五十萬美元的機密外交款項，陳水扁夫婦早前由於涉及機要費等弊案，被台北地院一審裁定終身監禁，他們決定提出上訴。

另一方面，陳水扁委託律師團，向美國軍事法庭，控告美國總統奧巴馬和國防部長蓋茨。陳水扁說，根據「舊金山和約」，美國擁有對台灣的軍事管理權，因此他的貪污案，應該由美國的軍事法庭審理，而非台灣的法庭。