港鐵六月十三日起加價，平均加幅百分之二點零五，不過部份車程，例如南昌至紅磡加幅高於百分之四。港鐵指，在加價後，有近一成乘客不受影響，大部份過海乘客加三毫至五毫，其餘加一至兩毫；由於今次調整收費機制，八達通會加至最接近一毫，而單程票就加至最接近五毫，所以會出現部份八達通收費，高於單程票價。另外，部份乘車優惠，包括長者兩元乘車優惠及西鐵輕鐵轉乘優惠會延長一年。