菲律賓總統阿基諾三世，就星期一人質事件流血告終後的記者會，微笑回答記者提問致歉，他指，他在高興時會微笑，在遇到荒謬的情況亦會微笑，他當時祗是感覺激怒，別無其他意思，如果引發誤解，對一些人造成冒犯，他願意道歉，他又不滿特警在營救人質時，行動遲緩，不應出現。 菲律賓當局正就營救人質行動展開調查，當日率領二百名特警強攻旅遊巴的四名特警指揮官被暫時解除職務，以免他們影響調查結果，此外，二百名執行任務的特警，被勒令交出武器，進行彈道測試，核查部份人質是否在槍戰中被特警流彈誤殺，而馬尼拉警察區長就提出在調查期間暫停職務。