審計報告揭露，過去兩個學年申請加學費的直資中學，部份學校帳目混亂，有直資學校以出現赤字為理由，申請加兩成半學費，但隱暪有一千五百萬元的儲備。前年申請加學費的三十間直資學校，九成都低估校方儲備金額，差額最大的達六倍。有學校違反規定，將儲備投資在股票及基金市場，涉及超過七千萬元市值；部分直資學校，將未經認可的捐款及周年晚宴開支，計入政府經費中，又動用一千萬元非政府資金買入三項物業，並以信託方式持有。 審計署促請當局，確保直資學校，按指引處理經費；教育局表示，會加強監察直資學校的儲備水平，確保校方提交合理的財政預測。直資學校議會就指，部份新開辦的直資學校，需時累積行政及財務管理經驗，認同審計報告有助辦學團體改善不足之處。