因建造成本上升，令港鐵正在動工興建的兩條新鐵路線，內部經濟回報率都較預期減少，其中今年五月動工的南港島線，建造成本由原先預期的七十億元，升至一百廿四億元，增幅七成七，內部經濟回報率由原先預期的百分之九，下降至百分之五點八；兩個月前動工的觀塘延線，建築費由四十二億，升至五十三億元，增幅兩成六，內部經濟回報，就由百分之八下調至百分之六點九。運輸及房屋局提交立法會文件指，連接鴨脷洲至金鐘的南港島線工程，作出多項修訂以回應居民，包括增建高架橋隔音屏障，將部份架空路段改為隧道等，都令成本上升；油麻地伸延至黃埔的觀塘延線，亦優化鐵路設施設計，相信能為市民帶來顯著經濟效益。