天主教香港教區前主教陳日君，對於教區司法覆核《校本條例》被終審法院駁回，表示遺憾，強調從來無講過上訴駁回，就會停辦所有天主教學校，相信家長不會容許，亦不會以公民抗命形式，不遵守新法辦學，因為政府一定會收回辦學權。

陳日君重申，校本條例嚴重損害教區辦學權，由法團校董會取代教區教學，是一個徹底及事關重要的改變，變相令教區喪失辦學權。