負責東江水供港的東深供水工程公司指，為確保供港水質符合標準，公司在零三年，耗資四十多億元人民幣，完成工程改造。現時供水管道已獨立於其他河道，同時從地面升高，確保不受地面污水滲透污染。本港與廣東省的供水協定即將到期，公司代表指近年多項工程令供水成本上升，但強調水價仍需廣東省與香港政府商討。