日本政府以強硬態度應對島嶼主權爭議。首相野田佳彥罕有在官邸發言，說無法容忍中韓兩國侵犯日本主權，強調在釣魚島及獨島問題上，決不讓步，又指近期發生的事令人遺憾，日本將堅決冷靜處理。他又說，將會在不妨礙警備工作的情況下，公開香港保釣人士登上釣魚島時，海上保安廳拍攝的片段。野田在參議院上又說，若海上保安廳無法防禦外國船隻入侵日本領海，自衛隊將會出動。日本眾議院就通過兩份，分別抗議本港保釣人士登上釣魚島，及南韓總統李明博登上獨島的決議案。野田佳彥又批評南韓，以郵寄掛號退回他寫給南韓總統李明博的親筆信；外相玄葉光一郎形容南韓的做法失禮，召見南韓駐日大使申玨秀抗議。日本又計劃取消購買南韓國債，又取消月底及下月的兩個日韓部長級會議。