被浸會大學免除當代中國研究所所長職務的薜鳳旋，發表聲明，不接受校方公布的《香港藍皮書》事件調查報告，認為未有客觀全面考慮他提供的資料，亦未給予他抗辯機會，薜鳳旋形容是文字獄，說感到「寒心」，他強調自己只是一句話的審校疏忽，尋求推翻調查裁決，或由其他途徑申訴。浸大回應指，調查小組是以公平公正原則調查、並以嚴謹而專業的態度，根據事實作出結論，強調浸大尊重學術自由，但學術自由不能凌駕於學術操守和法律之上。大學尊重薛鳳旋的個人言論，校長同校董會如有需要，會考慮聽取他的意見或申訴。大學與出版社取得共識，正全面回收三個版本的《香港藍皮書》。浸大當代中國研究所出版的《香港藍皮書》，指中大通職教育課程由美國資金贊助，教學方向受基金主導，被中大投訴失實。浸大調查後，認為作者薜鳳旋涉及學術不當，即時免除他的職務，亦不會同他續約，浸大並向中大致歉。