政務司長林鄭月娥表示，廉署在2011年底因應審計報告，實施檔案管理強制性規定前，一共銷毁七萬八千個檔案。林鄭月娥在立法會表示，廉署過去已參考政府檔案管理的做法，亦已根據廉署運作、保密需要、法例要求及檔案的歷史價值等，自行制訂檔案管理的政策，而目前廉署仍持有約十六萬二千個檔案。工黨何秀蘭指，廉署在實施規定前，每年平均銷毁一千九百個檔案，但實施規定後的一年內，只銷毁五十二個檔案，認為差距甚大，批評政府過去坐視不理，令廉署成為「無王管」的獨立王國。林鄭月娥解釋，差距可能反映廉署在檔案處理方面的行政效率，未必反映廉署刻意破壞有歷史價值的檔案。