政府與港鐵達成新票價可加可減機制，沿用現有方程式，再加入港鐵服務表現、盈利狀況及市民負擔能力等三項因素，按新機制，六月票價加幅，由原先計算的加3.2%，下調至加2.7%。政府消息人士估算，下調後的加幅，再加上港鐵各種優惠，六月實質的加幅只有1.1%，預計八成乘客每程車程加價三毫或以下。另外，新機制又規定每年整體票價調整，不得高於家庭每月收入中位數按年變動，而高出的加幅可於往後兩年追收。消息人士認為，港鐵作為上市公司，有財務考慮，又要支付各種優惠，追收做法並非不公平。

此外，港鐵將按盈利業績，亦會推出利潤分享計劃，為乘客提供第二程折扣優惠。另外，列車延誤三十一分鐘以上，政府會施以罰款，款項會注入利潤分享計劃。在新機制下，港鐵今年票務收入會減少近二億九千萬元。